生物化学:识别生化分子

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例子问题

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例子问题1:识别氨基酸

四氢叶酸到四氢叶酸亚甲基的转化与哪个氨基酸的转化相耦合?

可能的答案:

谷氨酸,谷氨酸盐

丝氨酸,苏氨酸

丝氨酸,甘氨酸

丝氨酸,丙氨酸

甘氨酸,丙氨酸

正确答案:

丝氨酸,甘氨酸

解释

四氢fulate转化为四氢fulate亚甲基与丝氨酸转化为甘氨酸的氨基酸相结合。丝氨酸转化成甘氨酸和甲醛。四氢叶酸转化为四氢叶酸亚甲基时,也考虑了相同的成分。

例子问题1:识别氨基酸

从溶液中分离出一种未知氨基酸。它有一个pH值为12时的电荷。它在滴定曲线上有3个等效点,具有两亲性。这是哪种氨基酸?

可能的答案:

色氨酸

组氨酸

谷氨酸

酪氨酸

苏氨酸

正确答案:

酪氨酸

解释

在pH值为12时,所有氨基酸的氨基都将被脱质子化,产生至少a来自酸基的电荷。另一个负电荷来自于骨架上的羧基。酪氨酸是两亲性的,它侧链的pKa是10.8,这意味着它是一个脱质子pH值为12。这给了它一个pH值为12时的电荷。色氨酸没有侧链pKa,所以没有3个等当点。苏氨酸也没有3个等当点。谷氨酸没有两亲性。组氨酸是两亲性的,但它是一种碱性氨基酸。

例子问题1:识别氨基酸

甘氨酸

上面显示的是哪种氨基酸?

可能的答案:

酪氨酸

亮氨酸

缬氨酸

甘氨酸

苯丙氨酸

正确答案:

甘氨酸

解释

所有的氨基酸都有一个氨基、一个羧基、一个氢原子和一个氨基酸特有的r基团。在这个结构中,r基团是一个氢原子,对应于甘氨酸氨基酸。

例子问题1:识别氨基酸

将水溶液中的蛋白质通过含有带负电珠的柱。在流动相运行结束后,发现柱内有少量蛋白质。以下哪一种氨基酸可能在少量蛋白质中含量较高?

可能的答案:

丙氨酸

酪氨酸

谷氨酸

赖氨酸

正确答案:

赖氨酸

解释

由于这是一种离子交换层析法,我们预计在柱中发现的蛋白质具有与珠子相反的电荷。由于珠子是带负电荷的,我们预计氨基酸是带正电荷的。赖氨酸有一个基本的侧链,可以很容易地从溶液中获得一个氢,并带正电。

例子问题1:识别氨基酸

假设在编码一种酶的活性位点上一个非常重要的氨基酸的DNA区域发生了突变。如果突变前该位点的原始氨基酸是赖氨酸,那么下列哪一种氨基酸替换可能是危害最小的?

可能的答案:

精氨酸

色氨酸

缬氨酸

谷氨酸

甘氨酸

正确答案:

精氨酸

解释

我们在题干中被告知,一个突变导致了一个氨基酸的取代。最初,由这个区域编码的氨基酸是赖氨酸残基。为了找到对生物体危害最小的氨基酸,我们需要识别出哪一种氨基酸与赖氨酸最相似。由于赖氨酸在生理条件下是一种基本氨基酸,它在大多数情况下会带正电荷。因此,我们正在寻找一种氨基酸,它也是碱性的,在生理条件下带正电荷。精氨酸就是一种符合这个标准的氨基酸,因此它是正确的答案。谷氨酸是不正确的,因为它在生理条件下是酸性的,因此会带负电荷。甘氨酸、缬氨酸和色氨酸也都不正确,因为这些氨基酸在生理条件下都是中性的。

例子问题1:确定生化分子

下列哪个氨基酸的侧链能够形成氢键相互作用?

即丙氨酸

2天冬氨酸盐

3苏氨酸

四、蛋氨酸

可能的答案:

二只

一,二,三

第二和第三

第三只

二,三,四

正确答案:

第二和第三

解释

只有天冬氨酸和苏氨酸具有能形成氢键相互作用的侧链。天冬氨酸有一个末端羧酸盐,它可以作为氢键受体,也可以在质子化时作为氢键供体。苏氨酸有一个末端羟基,也可以作为氢键供体。丙氨酸有一个完全的脂肪族侧链,不能参与氢键,而蛋氨酸有一个巯基,不能参与氢键。

例子问题1:识别单体和二聚体

关于测序方法,下列哪项是正确的?

可能的答案:

Edman降解可以对无限数量的氨基酸进行测序

琼脂糖凝胶电泳用于分离单个氨基酸分子

这些

高效液相色谱(HPLC)可用于分离多肽

正确答案:

高效液相色谱(HPLC)可用于分离多肽

解释

琼脂糖凝胶电泳通常用于大分子,而不是像单个氨基酸这样的小分子。等电聚焦通过等电点分离分子。Edman降解只允许测序约30个氨基酸,而不是无限的数量。高效液相色谱法分离蛋白质是肽序列。

示例问题8:识别氨基酸

假设一个pI = 10.4的氨基酸在酸性溶液中被强碱滴定,.当pH分别为2,8,12时,这种氨基酸的净电荷是多少?

可能的答案:

正面、中性、负面

正面的,积极的,中性的

积极的,中立的,中性的

积极的,消极的,负面的

正面的,积极的,消极的

正确答案:

正面的,积极的,消极的

解释

题目告诉我们这种氨基酸的pI = 10.4。因此,我们认为这是一个碱性氨基酸。这意味着一个羧基,一个氨基和一个碱性r基团会出现。

在滴定开始时,溶液的pH值很低,溶液开始呈酸性。在pH值为2时,由于在这个pH值下溶液中有如此多的质子,所有考虑的重要官能团都将被质子化。因此,氨基酸的每个基本官能团上都带一个正电荷,羧基上带一个中性电荷,使氨基酸的净电荷为+2。

一旦pH值上升到8,我们就会认为只有羧基会被脱质子化。结果是,羧基会带一个负电荷,而其他两个碱性官能团仍然会带正电荷。因此,在这个pH值下,氨基酸的净电荷为+1。

最后,一旦pH值一路攀升到12,我们可以预期两个基本官能团会被脱质子化。因此,每个碱性官能团都是中性的,而羧基仍然是负的。因此,在这个pH值下,氨基酸的总电荷为负。

所以总的来说,氨基酸是带正电的,然后是带正电的,然后是带负电的。

例子问题1:识别氨基酸

大多数天然氨基酸以l -异构体的形式存在。然而,这一趋势有一个例外。哪种氨基酸违背了这一趋势?

可能的答案:

酪氨酸

缬氨酸

甘氨酸

谷氨酸

组氨酸

正确答案:

甘氨酸

解释

存在于生物体中的大多数氨基酸都含有一个α碳,它是一个立体中心(或手性中心)。这意味着这个中心碳连着四个不同的取代基,因此允许氨基酸有两种可能的异构体。尽管自然界中几乎所有的氨基酸都是l -异构体,但甘氨酸是个例外。这是因为甘氨酸的-碳连着两个氢原子。因此,这个α -碳不是一个立体中心,这意味着甘氨酸只有一种可能的构象,没有异构体。

例子问题1:识别氨基酸

下列哪一种氨基酸不含环状结构?

可能的答案:

酪氨酸

苯丙氨酸

组氨酸

苏氨酸

色氨酸

正确答案:

苏氨酸

解释

色氨酸的侧基上有一个五元环和一个六元环。酪氨酸和苯丙氨酸都含有一个六元环。组氨酸的侧链上有一个五元环。苏氨酸的r基团,且不具有环形结构。

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