分类等级越高，成员间的相似性越小。外貌、行为和基因都是如此。分类分组的顺序，从最一般到最具体是:界、门、纲、目、科、属、种。

在给出的答案中，门是最高的分类等级。不同门的种间遗传差异最大。相比之下，属是给出答案的最低分类等级;同一属的种间遗传差异最小。

趋同进化是两个不同物种进化出共同特征的现象。一个典型的例子是，鸟类和蝙蝠都进化出了翅膀，但在进化出这一特征之前，它们并没有共同的祖先。鸟类和蝙蝠通过完全独特的机制分别进化出了翅膀。

居住在同一地区的种群分化为两个不同的物种，这就是同域物种形成的现象。一个物种重新获得某种特征是进化逆转的一个例子。

趋同进化是两个物种独立进化出相似特征的现象。一个很好的例子是鸟类和蝙蝠飞行/翅膀的进化，它们没有共同的祖先。简约是一种指导科学解释使用简单术语的原则，而不是复杂的原则。通过简单的思考，最简单的解释也最有可能是正确的。人工选择是进化的一种形式，在这种形式中，生物被选择和培育的有益特征在自然界中不一定会被选择。狗的繁殖和许多种类的农产品和谷物的生产都是由人类人为选择的(这与基因改造不同)。

分歧进化描述了不同特征的积累，这些特征可以导致物种形成事件。一个庞大的种群由单一的祖先物种组成。随着时间的推移，种群的不同群体开始居住在不同的生态位，并发展出专门居住该生态位的特征。随着这些变化的积累，人口慢慢地发展成不同的群体。当这些群体由于某种性障碍而不能再繁殖时，就发生了物种形成事件。这一过程与达尔文雀的进化理论相一致。

正确答案是异域物种形成。同域物种形成发生在两个生物种群居住在同一地理位置，但由于行为差异而形成物种。当两个生物地理上截然不同的种群存在一个小的杂交带或重叠时，就会发生跨物种形成。在这个问题的背景下，破坏性选择和自然选择并不能解释物种形成事件。

正确答案是同域物种形成。尽管罕见，同域物种形成发生在占据同一地理位置的种群中，但仍然发展出生殖隔离。这种隔离通常是由行为差异造成的。异域物种形成发生在生物地理上不同的种群中。当两个生物地理上截然不同的种群存在一个小的杂交带或重叠时，就会发生跨物种形成。平衡选择是指自然选择的一种模式，而不是物种形成。

线粒体DNA (mtDNA)只能从母亲直接遗传给她的后代，可以用来直接追踪一个种群或物种的血统。核DNA (nDNA)遗传自后代的父亲和母亲;它也可以用来追踪谱系，但mtDNA的相似性足以得出问题中所描述的两个种群之间的密切关系。

颜色、饮食和位置都是种群的显著特征，有助于确定它们在生态系统中的生态位。饮食和位置(领土)不是可遗传的特征，也不代表祖先。颜色是遗传的，但也可能是趋同或分化进化的结果。mtDNA的相似性是a和B种群之间存在密切祖先联系的最有力证据。

为了得到系统发育关系的准确估计，科学家需要在研究中使用中性DNA标记。如果基因处于某种选择之下，结果可能会完全改变，因为这可能不能反映生物体的实际进化历史。将细胞核DNA和线粒体DNA结合起来通常也很重要，因为这些类型的基因可以显示不同的历史(记住，线粒体DNA是母系遗传的)。