细菌能够以多种方式繁殖。二元分裂最类似于动物的有丝分裂，不涉及任何基因重组。DNA被复制并传递给相同的子细胞。

相比之下，其他列出的方法涉及到将外来DNA合并到细菌基因组中。在结合过程中，质粒通过性毛在细菌之间交换。在转化过程中，细菌能够直接从周围环境中吸收DNA。在转导过程中，噬菌体载体被用来将外来的DNA引入细菌细胞。

肽聚糖最为人所知的是它在细菌细胞壁形成中的作用。青霉素通过抑制肽聚糖的产生，阻止细菌充分发育，对治疗细菌感染非常有效。

抗组胺药和消炎药可以用来帮助预防引发过敏反应的自身免疫反应。杀菌剂被用来杀死真菌感染。病毒更难治疗，因为严格来说它们不是活的，不能被“杀死”。

细菌是单细胞生物，通过二元裂变繁殖，产生与原细胞相同的副本。

病毒需要活细胞才能繁殖。病毒侵入细胞，改变宿主细胞器的正常功能，转而复制病毒。真菌与细菌非常不同，因为它们的结构更复杂(真核生物)，它们通过发芽繁殖(以及其他机制)。原生动物包括单细胞类动物微生物。常见的原生动物感染包括疟疾和昏睡病。蠕虫是一种类似蠕虫的动物，包括蛲虫和绦虫。

革兰氏阳性菌产生的内生孢子可以休眠数年。内生孢子对革兰氏阳性细菌的生长至关重要，因为它们能抵抗极端温度、紫外线辐射和许多化学物质等恶劣条件。真菌无论如何都不能利用内生孢子。它们也不参与细菌的繁殖过程。

革兰氏染色过程中发生的主要反应是检测肽聚糖的存在。大多数细菌细胞壁含有肽聚糖，但含量不同。如果细胞含有大量的肽聚糖，它将保留结晶紫染料并显示紫色(这是革兰氏阳性)。如果细胞中不含有大量的肽聚糖，则会出现反染色，呈粉红色(这是革兰氏阴性)。

革兰氏染色并不能决定一个物种是否属于古菌领域。古生菌细胞壁不含肽聚糖，不会对染色产生反应。注意，古生菌和细菌是完全不同的领域，尽管它们有一些相似的特征。

细菌有三种主要形式。球形细菌被称为球菌。杆状的细菌叫做杆菌。螺旋菌是刚性的(螺旋体)、柔性的(螺旋体)或弯曲的(弧菌)。

链球菌是引起脓毒性咽喉炎的病原体，是革兰氏阳性(紫色染色)球菌属(球体)，其细胞倾向于形成链。细菌可以通过对革兰氏染色的反应和它们的外观来描述。例如，“革兰氏阳性链球菌”指的是染紫色的球形链。

细菌的肽聚糖层保留革兰氏染色。一般来说，革兰氏阴性菌比革兰氏阳性菌的毒性更强。这部分是由于革兰氏阴性菌的外层有一层脂多糖，它能引起免疫反应(特别是通过一种叫做脂质- a的成分)，而且在某种程度上更难被抗生素靶向。