由于趋同进化而产生的相似结构被称为类似结构，例如甲虫和鸟类的翅膀。这些动物没有共同的祖先，并形成了翅膀彼此独立的特征。同源结构是指两个生物由于与共同祖先的联系而具有相同的特征。例如，狗的腿和猫的腿是同源的。

系统发育指的是一个谱系的进化史，可以用来确定共同的祖先。分类学是对生物的命名和分类。双名命名法是包含其属和种的生物的学名。

类似结构是具有相似功能但独立产生的解剖结构。由于环境压力和自然选择，不同物种的生物独立进化和适应，导致具有相似功能的身体部分的存在。这指的是趋同进化。类似结构的一个例子是几种不同动物的翅膀。飞蛾、蜂鸟和蝙蝠在进化上只有极远的亲缘关系，但它们都有某种翅膀，用于在空中运输的共同目的。同源结构是解剖学上相似的身体部分，可能具有相似的解剖形式，但不是趋同进化的结果，而是发散进化的结果。有机体内部的这些共性表明它们来自同一个祖先。同源结构的一个例子是三种不同哺乳动物的“手臂”:人类、蝙蝠和鲸鱼。每只“手臂”都有非常相似的骨骼解剖组织，但用于非常不同的功能。

退化特征是一种失去功能但在进化中保留下来的属性。例如，人类的鸡皮疙瘩的形成，以及蟒蛇和蟒蛇的骨盆残余。细胞DNA序列(基因组)的改变就是突变。使生物更适合栖息地的特征是适应。在拥有共同祖先的生物中出现的结构，但表现出不同的结构被称为同源结构。同源结构的一个例子是哺乳动物的“手臂”。哺乳动物手臂上的骨骼和肌肉组织非常相似(鲸鱼、人类、蝙蝠)，但它们的功能却大不相同(游泳、抓取、飞行)。

人们相信所有的生物都来自于一个共同的祖先。这方面的证据包括形态相似性、退化特征和化石记录中的观察。近年来，人们利用DNA序列分析，建立了系统发育树和分支图，以确定生物基因组的相似性。

当一种动物的部分功能不同，但位置和骨骼结构相似(如狼的前臂和鲸鱼的鳍状肢)，并且来自同一个祖先时，这两种结构是同源的。趋同进化是一个过程，在此过程中，两个不相关的生物发展出类似的结构，具有相同的功能，但具有不同的结构。瓶颈效应指的是当种群数量突然下降，然后再次扩大时，遗传多样性会减少。孟德尔遗传定律指的是不同的性状或等位基因作为被称为基因的离散遗传单元从一代传递到下一代的规则。

根据定义，退化结构是指在很久以前被认为具有生物学功能的结构，但由于进化变化而失去了这种功能。人类阑尾被认为是退化结构的一个例子。

同源结构通过观察不同物种之间的结构相似性表明存在共同的祖先;然而，虽然人的手和猫的爪子在结构上很相似，但它们的功能却非常不同。

当基因的突变阻止它被读取时，如果编码酶产生的化合物可以很容易地从外部来源获得，这可能是有利的，从而节省了自己产生化合物所需的能量。

一个著名的例子是生产维生素C的GLO基因。在以水果为食的动物，如蝙蝠、豚鼠和人类中，这种基因仍然存在，但启动子破裂，使其失去功能。

返祖特征是进化有机体中祖先结构的罕见表现。由于海豚是从四条腿的哺乳动物进化而来的，一只海豚出生时就有一对后鳍，这表明它是一种返祖现象，一种进化上的倒退。

耳朵摆动是退化特征的一个例子。犀牛角与公羊角的关系代表了一种类似的和同源的结构。乌鸦的面部识别能力被认为是共同进化的产物。

在任何关于进化和遗传的真正准确的科学研究能够完成之前，学术界必须接受地球及其物种随着时间而变化的概念。如果物种是固定的，那么基因变异、自然选择和进化就不可能成立。一旦科学界承认了生物体的变化，他们就能够进行研究，以确定这种变化为什么以及如何发生。