淋巴系统负责从间质中去除多余的液体并将其返回到血液中。液体将流经淋巴结，淋巴结监测血液中微生物的存在。如果有微生物存在，淋巴结就会产生免疫反应。淋巴系统也会改变小肠毛细血管中的脂肪消化，并将它们排入颈部的静脉。淋巴管不协助氧气转移到身体组织。

红细胞通常不会离开循环系统;因此，淋巴管很少有机会在细胞外空间吸收红细胞。

淋巴系统在将免疫细胞(如淋巴细胞)运输到全身的过程中起着关键作用。当脂肪在小肠中乳化并被消化时，它们会被输送到淋巴而不是血液中。当血浆和液体从毛细血管中泄漏出来时，淋巴系统负责收集这些液体并将其返回循环。淋巴系统这一功能的缺陷会导致水肿。

一些病毒利用一种被称为潜伏期的机制来逃避免疫系统。病毒基本上处于休眠状态，通常在神经元等细胞中，这些细胞几乎没有主要组织相容性(MHC) I类分子。病毒复制有限到没有活性，再加上停留在MHC类I分子很少的细胞中，这两种因素的结合使得病毒可以逃避常规的免疫监测。

当情况出现时，例如由另一种病原体引起的感染或情绪压力引起的发烧，病毒可能会重新激活并导致疫情爆发。

t细胞通常用于识别抗原并将其护送到b细胞以引起反应(辅助t细胞)或识别与受感染细胞结合的抗体(细胞毒性t细胞)。相反，b细胞在抗原在细胞膜上结合后，会直接分泌针对抗原的抗体。

这两种类型的细胞都有可以与抗原结合的受体，允许识别和交流。其他共性包括跨膜结构域的存在和可变区域的存在，这将允许特异性的抗原结合。

两者的相似性主要是结构上的，而在功能上有很多不同。t细胞受体只会结合抗原的片段，而b细胞受体会结合完整的分子。只有t细胞受体会与主要组织相容性复合体(MHC)相互作用。虽然这两种受体的结构都是由肽链决定的，但b细胞使用重链和轻链，而t细胞使用α链和β链。

脾脏作为人体的血液过滤中心之一，在免疫系统中起着关键作用。它也参与作为淋巴器官，允许滤液从血液通过淋巴分布到身体。

巨噬细胞和中性粒细胞是免疫系统中负责吞噬作用的主要细胞。吞噬作用是指摄取物质。因此，这些细胞在体内起着“垃圾收集器”的作用。注定要被毁灭的细胞被特殊的分子标记为吞噬。